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神经元发育中lncRNA的m6A动态修饰通过稳定RNA结合蛋白调控mRNA翻译的功能
作者:生物谷    日期:2022-12-15
       中国科学院分子细胞科学卓越创新中心(生物化学与细胞生物学研究所)鲍岚研究组揭示了长链非编码RNA (lncRNA) Dubr的m6A修饰通过稳定YTHDF1/3复合体以及其介导的mRNA翻译从而调控轴突生长和神经元迁移的分子机制。

       神经元作为一类高度特化的细胞,具有复杂的树突和轴突。神经元胞体中的mRNA可以运输至树突和轴突,并通过mRNA局部动态翻译合成新蛋白,参与调控神经元发育以及神经网络的建立。前期研究发现,初级感觉神经元轴突中富集microRNAs(miRNAs),同时通过调控轴突中的局部翻译并参与轴突延伸。

       最近的研究发现,轴突富集的lncRNA ALAE通过竞争RNA结合蛋白 KHSRP并与Gap43 mRNA相互作用,从而调节轴突局部翻译和参与轴突生长。上述研究表明,非编码RNA在神经元的发育中发挥重要调控作用。
       RNA甲基化修饰是数百种RNA修饰中普遍和富集的修饰。N6-腺苷酸甲基化(N6-methyladenosine,m6A)是其中丰度最高的动态修饰,参与RNA代谢、剪接、翻译、出核和运输等重要细胞生物学过程。已有研究表明,m6A甲基化修饰在哺乳动物大脑中高度富集,同时在早期神经元分化、生长以及学习记忆等方面均发挥重要作用。
       尽管最近的研究提示lncRNA调控神经元轴突发育,但对这些lncRNA是否存在m6A修饰以及m6A修饰在lncRNA参与神经发育中的功能与作用机制知之甚少。
       研究对小鼠背根神经节(DRG)组织中的m6A-CLIP数据和不同组织发育测序的数据进行整合分析,发现lncRNA Dubr被 m6A高度修饰且在神经系统发育早期高表达。
       利用小鼠体外DRG组织培养、神经元微流小室分隔培养以及胚胎电转等方法,研究发现敲减Dubr可以阻碍DRG神经元的轴突生长以及导致皮层神经元迁移和轴突投射缺陷,而将Dubr的m6A修饰位点突变后则无法挽回神经元的发育缺陷。
       进一步,研究显示,Dubr通过m6A修饰位点与m6A阅读蛋白YTHDF1和YTHDF3相互作用,同时敲减Dubr或突变Dubr的m6A位点可以加速YTHDF1和YTHDF3蛋白进入蛋白酶体依赖的降解途径,最终导致蛋白水平显著下降。
       同时,Dubr、YTHDF1和YTHDF3均能调控与神经元发育相关分子Calmodulin和Tau的mRNA翻译,且Dubr通过m6A甲基化促进YTHDF1/3蛋白复合体的稳定来维持Calmodulin和Tau的mRNA翻译并促进感觉神经元的轴突生长和皮层神经元的正确迁移。
       研究揭示了神经元发育中lncRNA的m6A动态修饰通过稳定RNA结合蛋白调控mRNA翻译的功能。该研究加深了关于非编码RNA上m6A动态修饰功能和机制的认知,并为探究神经系统发育的复杂调控机制提供了新视角。
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