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肿瘤微环境中肿瘤相关干细胞和上皮细胞的免疫反应更为活跃
作者:生物谷    日期:2023-03-02
       宫颈癌(CC)是妇科第三大常见癌症和第四大致死原因,但其确切进展尚不明确,主要是由于肿瘤发生的不同阶段肿瘤微环境变化的高度复杂性所致。重要的是,缺乏对CC患者不同阶段肿瘤微环境(TME)的详细比较单核转录分析。
       来自佛山市第一人民医院的研究者们为破译宫颈癌的进展提供了重要的资源,并为开发诊断宫颈癌和治疗免疫抑制的TME的新方法奠定了基础。

       从I期和II期CC患者的肿瘤组织中提取了42,928和29,200个核,并进行了单核RNA测序(SnRNA-seq)分析。利用生物信息学工具对细胞异质性和功能进行比较研究。此外,还进行了基于无标记定量质谱学的蛋白质组学分析。比较I期和II期CC患者的蛋白质组图谱,并与SnRNA-seq进行整合分析。

       与I期CC(CCI)患者相比,II期CC(CCII)患者多种免疫细胞中与免疫反应相关的信号通路受到抑制,但与细胞和组织发育相关的信号丰富,线粒体相关基因上调提示代谢产生能量。这与定量蛋白质组学分析显示CCII组TME中促进细胞生长和细胞间基质发育的蛋白质占主导地位是一致的。
       在脑梗塞患者的许多细胞群体中,干扰素-α和γ反应出现了最活跃的通路。在CCII组中发现COL12A1、COL5A1、COL4A1和COL4A2等几种胶原蛋白显著上调,提示它们在诊断CC进展中的作用。一个新的转录本AC244205.1被检测到是CCII患者中最上调的基因,其在CC中的可能机制可能被进一步研究。
       在这项研究中用SnRNA-seq和无标记定量蛋白质组学方法比较研究了I期和II期CC患者的TME。结果表明,II期CC患者几乎所有免疫细胞,包括MΦs、T细胞、B细胞、NK细胞和树突状细胞的异质性受到很大程度的调节,其表型具有明显的免疫抑制作用。相比之下,这些细胞在I期CC患者中表现出高免疫反应,其中干扰素-α和γ反应是最活跃的信号通路。几个组蛋白显示了在早期诊断CC的潜力。
       对于II期CC患者,多种细胞类型的SnRNA-seq分析和蛋白质组分析分别鉴定出胶原蛋白的显著上调,提示它们可能作为预后标志物。首次揭示了新转录本AC244205.1的异常表达与II期CC的相关性。这些发现为宫颈癌的临床诊断和免疫治疗提供了重要线索,值得进一步研究。
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