胚胎干细胞(ESC)具有自我更新的双重能力和分化的潜能,而两者都需要受到严格的调节控制。在ESC分化过程中,干细胞会发展为特殊的细胞类型,例如皮肤细胞,神经细胞,肌肉细胞等。虽然对ES细胞调控的理解主要在于转录和表观遗传差异等方面,但我们对转录后调控的作用仍知之甚少。
最近,丹麦的一个研究小组发现了由PolyA-tail eXosome Targeting'(PAXT)调控的核RNA水平升高以及Polycomb Repressive Complex 2(PRC2)调控的转录之间的关系。研究人员提出,过量的RNA会通过隔离DNA来阻碍PRC2的功能。他们的结果强调了核RNA水平稳态的重要性,并证明了大分子RNA调节染色质相关蛋白的能力。
此前的研究中,实验室发现了PAXT并将其表征为衔接子复合体,该复合体将多聚腺苷酸化(pA +)RNA靶向核RNA外泌体以进行衰变。在包括锌指蛋白ZFC3H1在内的PAXT水平下降之后,细胞就会稳定并积累pA + RNA。这为研究细胞核中过量pA + RNA的作用提供了方法。
有趣的是,在小鼠ESC中使用CRISPR / Cas9去除PAXT的组分“ZFC3H1“后,细胞的分化能力遭到了破坏。高通量测序分析显示Zfc3h1-/-敲除ES细胞显示出分化相关RNA的表达增加,而这些表达通常被PRC2复合物沉默。
进一步研究表明,由于Zfc3h1-/-KO导致RNA过量结合,PRC2复合物的功能和稳定性受到损害。总之,这突出了通过保持RNA衰变以维持核转录组稳定的重要性,以防止由于RNA积累而产生脱靶效应。